Przejdź do treści
KSeF dla apteki – faktury z hurtowni farmaceutycznych i marża na kategoriach
Start Blog Eksport i arkusze
Eksport i arkusze · Poradnik

KSeF dla apteki – faktury z hurtowni farmaceutycznych i marża na kategoriach

Apteka automatycznie pobiera faktury kosztowe od kilku hurtowni farmaceutycznych i dostawców kosmetyków w jednym arkuszu z podziałem na kategorie – rozliczenia refundacji z NFZ nie przechodzą przez KSeF, więc zostają w osobnym systemie.

Wypróbuj za darmo
AK Anna Kowalczyk 7 min Akt. 10 sierpnia 2026 Zweryfikowane
Szybka odpowiedź

Jak apteka może śledzić faktury z hurtowni farmaceutycznych i marżę na kategoriach?

Podłącz w panelu KSeF Import certyfikat dla NIP-u apteki, a aplikacja automatycznie pobierze faktury kosztowe od wszystkich hurtowni farmaceutycznych i dostawców kosmetyków czy suplementów. Dane trafiają do Google Sheets lub Excela z kolumnami: data, NIP, nazwa dostawcy, netto/VAT/brutto oraz oznaczeniem GTU. Raz dodaj słownik NIP → kategoria (Rx, OTC, suplementy, kosmetyki) i skonfiguruj formułę QUERY – od tej pory sama grupuje koszty per kategoria co miesiąc. Rozliczenia refundacji z NFZ nie przechodzą przez KSeF – to osobny system, który KSeF Import nie obejmuje.

TL;DR – w skrócie
  • KSeF Import pobiera faktury kosztowe od wszystkich hurtowni farmaceutycznych naraz – bez logowania do portalu MF, automatycznie w tle.
  • Słownik NIP → kategoria (tworzysz raz) dekoduje każdą fakturę na dział: leki Rx, leki OTC, suplementy, kosmetyki, wyroby medyczne.
  • Marża per kategoria gotowa po skonfigurowaniu formuły w arkuszu – podstawa decyzji o zamówieniach i negocjacji z hurtownią.
  • Rozliczenia refundacji leków z NFZ nie przechodzą przez KSeF – to odrębny system rozliczeń aptek, poza zakresem eksportu.
  • Faktury zakupowe eksportujesz z oznaczeniem GTU (w tym GTU_09, gdy wystawca je umieści przy lekach) – gotowe do zestawienia z rejestrem VAT przed JPK_V7.
W tym artykule

Od problemu do efektu

PWE
1
Problem
Kilka hurtowni, dziesiątki faktur, zero podziału na kategorie

Apteka zamawia z głównej hurtowni nawet kilka razy dziennie, a osobno rozlicza dostawców kosmetyków, suplementów i wyrobów medycznych. Suma kosztów na koniec miesiąca się zgadza, ale marża na lekach OTC czy kosmetykach to zgadywanie.

2
Jak rozwiązujemy
Automatyczny rejestr od wszystkich dostawców

KSeF Import łączy się certyfikatem apteki z API KSeF i pobiera faktury od każdej hurtowni oraz dostawcy cyklicznie. Słownik NIP → kategoria dekoduje je automatycznie na dział asortymentowy.

3
Efekt
Marża per kategoria gotowa co miesiąc

Leki Rx, OTC, suplementy, kosmetyki – każda kategoria z sumą kosztów i udziałem procentowym, bez ręcznego przepisywania faktur z segregatora.

Kilka hurtowni farmaceutycznych, jeden segregator faktur

Farmaceuta prowadzący aptekę zna ten rytm: główna hurtownia (np. Neuca, PGF Urtica lub Farmacol) dowozi towar nawet kilkukrotnie w ciągu dnia, bo zapas leków recepturowych i chłodniczych trzyma się minimalny. Do tego osobny dostawca suplementów, inny kosmetyków, kolejny wyrobów medycznych. Każdy wystawia fakturę w KSeF w swoim rytmie – część codziennie, część raz w tygodniu, część zbiorczo na koniec miesiąca.

Skala jest realna: jedna tylko hurtownia grupy Pelion, PGF Urtica, obsługuje miesięcznie ponad 40 tysięcy zamówień dla około 4 tysięcy odbiorców – to średnio około dziesięciu dostaw i faktur miesięcznie na aptekę, i to od jednego dostawcy z kilku. Doliczając mniejsze hurtownie i dostawców pozaaptecznych, suma dokumentów kosztowych w typowej aptece liczy się w dziesiątkach miesięcznie.

40 000+
zamówień miesięcznie obsługuje jedna duża hurtownia farmaceutyczna (PGF Urtica) dla ok. 4 tys. odbiorców
Apteka współpracująca z 2-3 hurtowniami dostaje więc faktury kosztowe praktycznie każdego dnia roboczego.
Suma się zgadza, marża – nie

Miesięczny koszt zakupu leków i towarów widać w księgowości od razu. Ale czy wiesz, ile z tego kosztu poszło na leki Rx, ile na OTC, ile na suplementy, a ile na kosmetyki? Bez podziału na kategorie nie policzysz marży na żadnej z nich osobno.

Marża, której nie widać: Rx vs. OTC vs. suplementy vs. kosmetyki

Leki na receptę (Rx) mają regulowaną, niską marżę urzędową. Leki bez recepty (OTC), suplementy diety i kosmetyki – marżę wolnorynkową, zwykle wyraźnie wyższą. Apteka, która nie rozdziela kosztów według tych kategorii, nie wie, który segment asortymentu faktycznie zarabia, a który tylko przepływa przez kasę.

  • Faktury od hurtowni głównej mieszają leki Rx, OTC i czasem wyroby medyczne na jednym dokumencie – bez ręcznego rozbicia pozycji nie rozdzielisz kosztów.
  • Dostawcy kosmetyków i suplementów wystawiają osobne faktury, które łatwo pominąć przy szybkim liczeniu marży na koniec miesiąca.
  • Bez historii porównawczej nie widać, czy koszt zakupu danej kategorii rośnie kwartał do kwartału, bo dane leżą w różnych segregatorach i mailach.
Skonfiguruj raz, pobieraj jednym kliknięciem

Zobacz, jak KSeF Import pobiera faktury kosztowe i układa je w gotowy arkusz.

Wypróbuj za darmo

Faktury od wszystkich hurtowni i dostawców w jednym arkuszu

KSeF Import rozwiązuje oba problemy naraz. Aplikacja łączy się z kontem apteki w KSeF i pobiera faktury kosztowe od wszystkich dostawców – bez logowania do portalu MF, automatycznie w tle. Każda nowa faktura od hurtowni, dostawcy suplementów czy kosmetyków trafia do arkusza Google Sheets lub pliku Excel w ramach jednego cyklu synchronizacji.

  1. 1
    Wgraj certyfikat dla NIP apteki

    W panelu wejdź w Certyfikaty i dodaj plik .p12 lub .pfx – ten sam, którego używasz do logowania w KSeF. Certyfikat szyfrujemy AES-256-GCM kluczem generowanym osobno dla każdego konta i trzymamy na serwerach w Unii Europejskiej (OVH). Wgrywasz go raz.

  2. 2
    Podłącz Google Sheets lub ustaw eksport Excel

    W ustawieniach eksportu wskazujesz arkusz Google lub pobierasz plik .xlsx. Kolumny: data wystawienia, NIP dostawcy, nazwa dostawcy, numer faktury, oznaczenie GTU, netto/VAT/brutto.

  3. 3
    Stwórz słownik NIP → kategoria (jednorazowo)

    W osobnym arkuszu tworzysz tabelę: NIP dostawcy → kategoria asortymentowa. Hurtownia główna → Rx/OTC (jeśli rozbija pozycje), dostawca suplementów → Suplementy, dostawca kosmetyków → Kosmetyki. Formuła WYSZUKAJ.PIONOWO (VLOOKUP) dekoduje każdą kolejną fakturę automatycznie.

  4. 4
    Ustaw harmonogram synchronizacji

    Wybierasz częstotliwość: co 6 h (plan Firma), co 2 h (plan Grupa) lub co 15 min (plan Biuro) – dopasowaną do tego, jak często potrzebujesz świeżych danych o kosztach.

  5. 5
    Odbierz raport per kategoria

    Formuła QUERY w Google Sheets grupuje sumy po kategorii i miesiącu – gotowa tabela z kosztem i udziałem procentowym każdej kategorii asortymentowej, bez ręcznych obliczeń.

Wskazówka: pierwsze pobranie

Przy pierwszej synchronizacji system pobiera historię do 90 dni wstecz, partiami w tle, respektując limity API KSeF. Zostaw na noc – rano masz komplet bez ręcznego ponawiania.

Refundacja NFZ nie przechodzi przez KSeF – ważne rozgraniczenie

Rozliczenie refundacji leków z Narodowym Funduszem Zdrowia to osobny system, niezależny od Krajowego Systemu e-Faktur. Standardowe rozliczenia refundacyjne nie wymagają wystawienia faktury VAT i w efekcie nie są w ogóle raportowane przez KSeF. KSeF Import eksportuje wyłącznie faktury zakupowe od hurtowni i dostawców – nie zastąpi i nie zintegruje się z rozliczeniem refundacji wobec NFZ.

Co eksportuje KSeF Import, a czego nie

Eksportuje: faktury kosztowe od hurtowni farmaceutycznych, dostawców suplementów, kosmetyków i wyrobów medycznych – z numerem KSeF, GTU, kwotami i datą wystawienia. Nie eksportuje: rozliczeń refundacyjnych z NFZ ani danych realizacji recept, bo te procesy nie przechodzą przez KSeF.

Dla apteki oznacza to jasny podział pracy: rejestr kosztów zakupu prowadzisz w arkuszu z KSeF Import, a rozliczenie refundacji zostaje w dotychczasowym systemie sprawozdawczym do NFZ – oba procesy nie mieszają się w jednym pliku.

GTU w eksporcie faktur – co widać przy lekach

Kod GTU_09 w JPK_V7 dotyczy dostawy produktów leczniczych oraz wyrobów medycznych i środków spożywczych specjalnego przeznaczenia żywieniowego objętych obowiązkiem zgłoszenia z art. 37av Prawa farmaceutycznego – w praktyce aptecznej najczęściej dotyczy to leków. Zwykłe suplementy diety zazwyczaj nie mieszczą się w tej definicji, więc dokładną kwalifikację danej pozycji warto zawsze zostawić hurtowni wystawiającej fakturę i księgowej. KSeF Import niczego tu nie klasyfikuje – eksportuje jako osobną kolumnę dokładnie to oznaczenie GTU, które wystawca umieścił na fakturze w KSeF, więc przed wysyłką JPK_V7 możesz od razu sprawdzić, czy żadna faktura z hurtowni nie ma pustego pola GTU tam, gdzie powinno być wypełnione.

Co eksportuje KSeF ImportDo czego się przydaje w aptece
Numer KSeF + data nadania numeru KSeFPodstawa ujęcia kosztu i weryfikacji terminu odliczenia VAT – to data nadania numeru KSeF liczy się jako data otrzymania faktury
Oznaczenie GTU (w tym GTU_09)Kontrola przed wysyłką JPK_V7 – brakujące GTU to ryzyko wezwania z urzędu
NIP i nazwa dostawcyPodstawa słownika NIP → kategoria asortymentowa
Netto / VAT / brutto per fakturaSumowanie kosztów per kategoria formułą QUERY w arkuszu

Ile to realnie zmienia na koniec miesiąca

EtapBez KSeF ImportZ KSeF Import
Zebranie faktur od hurtowniręczne pobieranie z portalu MF lub maili, ryzyko pominięciaautomatyczne, w tle, przez cały miesiąc
Podział na kategorieręczny przegląd pozycji faktury, godziny pracysłownik NIP → kategoria, formuła QUERY, kilka minut
Kontrola GTU przed JPK_V7ręczne sprawdzanie pozycji w PDFkolumna GTU w arkuszu, filtr pustych komórek
Raport dla księgowejstos PDF-ów per hurtowniagotowy rejestr zakupów z podziałem na kategorię i VAT

Jeśli apteka działa w sieci kilku placówek, każda z osobnym NIP-em, KSeF Import obsługuje wiele NIP-ów w jednym koncie – faktury z każdej apteki trafiają do arkusza z kolumną identyfikującą placówkę. Gdy chcesz zestawić zakupy od hurtowni z własną sprzedażą apteki w jednym widoku, prowadź osobny rejestr faktur sprzedażowych i kosztowych z KSeF zamiast ręcznie rozdzielać wspólną listę co miesiąc.

Najczęstsze pytania

Krótkie, konkretne odpowiedzi na pytania, które zadają użytkownicy i wyszukiwarki.

Tak. Jedna konfiguracja certyfikatu dla NIP-u apteki wystarczy, żeby pobrać faktury kosztowe od wszystkich hurtowni i dostawców, którzy wystawili je w KSeF – nie trzeba niczego konfigurować osobno dla każdej hurtowni.

Nie. Standardowe rozliczenia refundacyjne z Narodowym Funduszem Zdrowia nie wymagają faktury VAT i nie są raportowane przez KSeF, więc KSeF Import ich nie obejmuje. Aplikacja eksportuje wyłącznie faktury zakupowe od hurtowni i dostawców, które przeszły przez Krajowy System e-Faktur.

Zależnie od planu: Firma synchronizuje co 6 godzin, Grupa co 2 godziny, Biuro co 15 minut. Nowa faktura trafia do arkusza w ramach jednego cyklu synchronizacji od momentu nadania jej numeru KSeF.

Tak. Każdy NIP ma własny certyfikat, własny harmonogram synchronizacji i może mieć osobny arkusz lub wspólny z kolumną identyfikującą placówkę – zależnie od wybranego planu.

Tak, ale tworzysz go raz. To prosta tabela dwukolumnowa: NIP dostawcy i nazwa kategorii (Rx, OTC, suplementy, kosmetyki). Formuła VLOOKUP lub QUERY w arkuszu dekoduje każdą kolejną fakturę automatycznie, bez ponownego wpisywania.

Nie – KSeF Import eksportuje wyłącznie dane, które hurtownia lub dostawca faktycznie umieścił na fakturze w KSeF. Jeśli pole GTU jest puste u wystawcy, w eksporcie też będzie puste; kolumna GTU pozwala jednak szybko wychwycić taki brak przed wysyłką JPK_V7.

AK
Anna Kowalczyk
Specjalistka ds. KSeF

Specjalistka ds. KSeF w zespole redakcyjnym KSeF Import. Pisze o eksporcie faktur z Krajowego Systemu e-Faktur do arkuszy i rozliczaniu kosztów.

Merytorycznie zweryfikował Michał Wójcik – Inżynier integracji KSeF.
Wszystkie artykuły na blogu

Przeczytaj również

Faktury z KSeF automatycznie
7 dni za darmo · bez karty
Wypróbuj
7 dni za darmo · bez karty kredytowej

Przestań przepisywać faktury ręcznie

Wgraj certyfikat raz i pozwól, by faktury kosztowe z KSeF same trafiały do Excela, Google Sheets, CSV i zbiorczego PDF – bez logowania do portalu MF.

Bez karty kredytowej Konfiguracja w 5 minut Serwery w EU · GDPR